物流管理应用管理会计是以物流成本为中心，通过对物流成本分析，对物流活动进行预测、决策、规划和控制。其目的在于通过对物流成本习性的研究、费用水平的推测及控制，以及不同物流方案的比较，为有关部门制定决策服务，以实现物流活动的最优化和企业效益的最大化。物流管理会计是为企业物流管理服务的，它强调“事前计划、事中控制、事后反馈三部曲的统一，工商税务咨询，体现了一套预测、计划、决策、控制、分析、考核的管理模式”。
与代理理论平行发展的是交易成本理论。交易成本理论不同于代理理论的是其不总是借助正式合约来分析所有交易，认为企业是为了应付复杂的、不确定的环境而建立的合作组织，交易改在企业内部完成并由管理过程控制，可以弥补具有一定成本和效率损失的市场交易的局限。交易成本理论应用的缺陷在于交易成本环境难于准确定义，工商税务，仅以有限方式在实际组织中进行了检验，多数结论缺乏缜密的分析，管理会计中心问题即分权经营单位的业绩评价的手段没有得到相应的发展。折现的现金流量法虽然在理论上优于非折现的投资回收期法和会计收益率法等传统方法，但对于许多投资而言不符合成本效益原则，工商税务处理，在企业如何实施仍是难以解决的问题，工商税务注册，更何况未来的现金流量本身就很难确定，实务上更多的是采用非折现的投资回收期法。折现的现金流量法虽然在理论上优于非折现的投资回收期法和会计收益率法等传统方法，但对于许多投资而言不符合成本效益原则，在企业如何实施仍是难以解决的问题，更何况未来的现金流量本身就很难确定，实务上更多的是采用非折现的投资回收期法。
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